Affine Alignment
 
Alignment between hcf-1 (top C46A5.9 782aa) and hcf-1 (bottom C46A5.9 782aa) score 80313

001 MDEDVGLEATNYSRGDESRSEEQEKNVVRWRIVQQSTGPNPKPRHGHRAVVLKELIVIFG 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MDEDVGLEATNYSRGDESRSEEQEKNVVRWRIVQQSTGPNPKPRHGHRAVVLKELIVIFG 060

061 GGNEGMIDELHAYNTQKREWTAPQCCGDVPTPAAAFGAISLGNKIYRFGGMTEYGKYTND 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 GGNEGMIDELHAYNTQKREWTAPQCCGDVPTPAAAFGAISLGNKIYRFGGMTEYGKYTND 120

121 LYELQSTRWEWRRLNPRVHSNGHLPCPRIGHSFVVSQKSQKAYVFGGLSNDLNDPKRNVP 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 LYELQSTRWEWRRLNPRVHSNGHLPCPRIGHSFVVSQKSQKAYVFGGLSNDLNDPKRNVP 180

181 HYLDDLYVINLSGPQHLIWEKLNATGPGPISRESHTAVIYEKDSISRMVVYGGMNGVRLG 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 HYLDDLYVINLSGPQHLIWEKLNATGPGPISRESHTAVIYEKDSISRMVVYGGMNGVRLG 240

241 DLWYLNLNTLHWTEIKFDDPRTGIPPMPRSLHSSVLIGDKMFVYGGWVPLLEHASTEQQT 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 DLWYLNLNTLHWTEIKFDDPRTGIPPMPRSLHSSVLIGDKMFVYGGWVPLLEHASTEQQT 300

301 EKEWKCTSSLGCWNITEDRWVPLHLYCSDEDTIPRGRAGHCAAAVGDRMYIWSGRDGYRK 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 EKEWKCTSSLGCWNITEDRWVPLHLYCSDEDTIPRGRAGHCAAAVGDRMYIWSGRDGYRK 360

361 AWSNQVCCRDMWLLDTILPEQPGKVQLGRAGFNSLEISWPIVQGASGYFLQIGFGDAKEQ 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 AWSNQVCCRDMWLLDTILPEQPGKVQLGRAGFNSLEISWPIVQGASGYFLQIGFGDAKEQ 420

421 SVSPIKRATTSPRKQPSIVPPSQKETEQSPKKPQGTAPSIISTQGTTYTAPADPKPATDE 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 SVSPIKRATTSPRKQPSIVPPSQKETEQSPKKPQGTAPSIISTQGTTYTAPADPKPATDE 480

481 GGLPQDLFEDTEKNETASPKRSNDAQSADSSTCEQKKTDESGLEEDSEKDQKPSDAGETD 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 GGLPQDLFEDTEKNETASPKRSNDAQSADSSTCEQKKTDESGLEEDSEKDQKPSDAGETD 540

541 EMKEENGDDDLPWFDVGIIDKATINVTHYFNDRQQSLEKQLNDLIDHNAFKCVNDSVFTT 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 EMKEENGDDDLPWFDVGIIDKATINVTHYFNDRQQSLEKQLNDLIDHNAFKCVNDSVFTT 600

601 EDKIPLINGQSYRFRVSAINGLGKGAWSETASCKTCVPGYPSAPSSIRITKSHEGAQLTW 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 EDKIPLINGQSYRFRVSAINGLGKGAWSETASCKTCVPGYPSAPSSIRITKSHEGAQLTW 660

661 EPPSNTNISGKIIEYSVYLAVKNQSANSADSQLAFMRVYCGPQADCQVLQSNLGTAFVDQ 720
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
661 EPPSNTNISGKIIEYSVYLAVKNQSANSADSQLAFMRVYCGPQADCQVLQSNLGTAFVDQ 720

721 TNKPAIIFRIAARNEKGYGPATQVRWLQDQQKIPVRTNYPNNSGFIYQQHGGQQKRARFD 780
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
721 TNKPAIIFRIAARNEKGYGPATQVRWLQDQQKIPVRTNYPNNSGFIYQQHGGQQKRARFD 780

781 HQ 782
    ||
781 HQ 782