Affine Alignment
 
Alignment between cdc-6 (top C43E11.10 518aa) and cdc-6 (bottom C43E11.10 518aa) score 48868

001 MSSKSGSTRKSQRARDFEESEETEKPSLTRRKSSRLSTQSVPIEKKKTPSSKTTKRVPVS 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSSKSGSTRKSQRARDFEESEETEKPSLTRRKSSRLSTQSVPIEKKKTPSSKTTKRVPVS 060

061 ERVFHEEVESSSEDELLPQTKMASEEKRKLLLSPGSSLADRVEKLEISSPRARGRPRKAT 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 ERVFHEEVESSSEDELLPQTKMASEEKRKLLLSPGSSLADRVEKLEISSPRARGRPRKAT 120

121 NLKSQLTTPRTPEKQSRSRSGSQGTPEKKSRKESSSESDSEEIISTSSEGALKGRREEFD 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 NLKSQLTTPRTPEKQSRSRSGSQGTPEKKSRKESSSESDSEEIISTSSEGALKGRREEFD 180

181 SLKLWIMKSKETNTSLSIYVSGQPGTGKTATTMRVLKSLGKSVRSCIVNCASTNTKSALF 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 SLKLWIMKSKETNTSLSIYVSGQPGTGKTATTMRVLKSLGKSVRSCIVNCASTNTKSALF 240

241 KTIFESLDLDGKPNEEIFEKHVKQFKTPLVLVLDEIDHLANRKNAALYAAFQWPETLSRK 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 KTIFESLDLDGKPNEEIFEKHVKQFKTPLVLVLDEIDHLANRKNAALYAAFQWPETLSRK 300

301 IIILGIANSIDLTERLLPKLMLAKPPKRLVFEPYTKDDIVEILNDKMKNEETSIDAKAIE 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 IIILGIANSIDLTERLLPKLMLAKPPKRLVFEPYTKDDIVEILNDKMKNEETSIDAKAIE 360

361 LTARKVAAMSGDLRTALHIFKQQKSRMIPDDSKVPGTPVNGCREVLGIINNVYSSPLARA 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 LTARKVAAMSGDLRTALHIFKQQKSRMIPDDSKVPGTPVNGCREVLGIINNVYSSPLARA 420

421 RLPLQPRILLAVSLTLSANKKCTFDRNSLLRAYYKACEALRMPALDDDELHSAFQTLESQ 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 RLPLQPRILLAVSLTLSANKKCTFDRNSLLRAYYKACEALRMPALDDDELHSAFQTLESQ 480

481 SFVRQLNGGKLVLQVDAPTAKSAISDNAMLDQIGLLQF 518
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 SFVRQLNGGKLVLQVDAPTAKSAISDNAMLDQIGLLQF 518