Affine Alignment
 
Alignment between cogc-5 (top C43E11.1 580aa) and cogc-5 (bottom C43E11.1 580aa) score 55993

001 MADEDILVDGRPLSSLKVTELKEELENRQLSTKGVKAVLQERLREALAAQGDDPVVDEQN 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MADEDILVDGRPLSSLKVTELKEELENRQLSTKGVKAVLQERLREALAAQGDDPVVDEQN 060

061 PIVAGYLARQSAALAEARKRTESEASGTTTPQSEVSPSKQSEASPRKGRTPRKEKKDVEP 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 PIVAGYLARQSAALAEARKRTESEASGTTTPQSEVSPSKQSEASPRKGRTPRKEKKDVEP 120

121 EAEPEPEADIAPEPEKVAIVEKPEPKPEPITETEASPSKASEKDAAVEVSVEKVDAETAQ 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 EAEPEPEADIAPEPEKVAIVEKPEPKPEPITETEASPSKASEKDAAVEVSVEKVDAETAQ 180

181 ESDSPQEAEKEKTEPQVELENGGQEEDEPDRDESIEKQPEKEDDGDELDYGDDEEKEQKD 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 ESDSPQEAEKEKTEPQVELENGGQEEDEPDRDESIEKQPEKEDDGDELDYGDDEEKEQKD 240

241 DESMDAEDAKEEKVVQIEKEKKEDKDDGVKKEEKVREVSRRRVSSPSSRHPVSNVVHIRG 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 DESMDAEDAKEEKVVQIEKEKKEDKDDGVKKEEKVREVSRRRVSSPSSRHPVSNVVHIRG 300

301 LTRPFTEGQLRAEIQKNCGEIVDLWMDKVKSHCFVKLNSDADAGNVISAMNNVVWPDGNP 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 LTRPFTEGQLRAEIQKNCGEIVDLWMDKVKSHCFVKLNSDADAGNVISAMNNVVWPDGNP 360

361 KRLSIVYDTEDNLIKHRNGLEATIAEPAKIGGGRADRLSTTSQSSILGGKTNFQITMQNV 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 KRLSIVYDTEDNLIKHRNGLEATIAEPAKIGGGRADRLSTTSQSSILGGKTNFQITMQNV 420

421 LRDNDKLDSERKRERGSIQSRLTRIENKDQVKDEKKDEKKEDRKRKRSETPPFSRGAGFM 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 LRDNDKLDSERKRERGSIQSRLTRIENKDQVKDEKKDEKKEDRKRKRSETPPFSRGAGFM 480

481 DEKKARNEERERRREGPRSEERRKVVVEEEEAPKKSLDQLFKKTVALPPIYYLPLTEEQI 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 DEKKARNEERERRREGPRSEERRKVVVEEEEAPKKSLDQLFKKTVALPPIYYLPLTEEQI 540

541 AAKEAEKSAKGKERAETTSDRDRPHRVDRNDRGDRPRHRD 580
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 AAKEAEKSAKGKERAETTSDRDRPHRVDRNDRGDRPRHRD 580