Affine Alignment
 
Alignment between aqp-5 (top C35A5.1 290aa) and aqp-5 (bottom C35A5.1 290aa) score 28880

001 MSMNSQKTSTVRPYNLISRCYAEFLGTFIFIFSGTMQANVYDISQPVGLTHAALTHGLAT 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSMNSQKTSTVRPYNLISRCYAEFLGTFIFIFSGTMQANVYDISQPVGLTHAALTHGLAT 060

061 IVVIAVFGKISGGHFNPVVSWAMVLCQKLHPFELPFYMFSQFFGGFAGNLLSACLQRKRD 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 IVVIAVFGKISGGHFNPVVSWAMVLCQKLHPFELPFYMFSQFFGGFAGNLLSACLQRKRD 120

121 FLNWEDYSSIRYPLPTASIEYGYDKVHNSTLEKTILLTTQLAATTSGITHLGENHEWWEG 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 FLNWEDYSSIRYPLPTASIEYGYDKVHNSTLEKTILLTTQLAATTSGITHLGENHEWWEG 180

181 LISETITTYFFVTVILMNVVNNEPSEATPFIIGMMVIVNIFATASITGTAMNPVRALSPN 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LISETITTYFFVTVILMNVVNNEPSEATPFIIGMMVIVNIFATASITGTAMNPVRALSPN 240

241 IVGEIVLSSSSLPPNFWTYHYIYWAGPYLGSTIAVIGFKLLLSKTDRLIP 290
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 IVGEIVLSSSSLPPNFWTYHYIYWAGPYLGSTIAVIGFKLLLSKTDRLIP 290