Affine Alignment
 
Alignment between ccdc-55 (top C16C10.6 392aa) and ccdc-55 (bottom C16C10.6 392aa) score 37962

001 MASKRHVGLNIRKKDEPKAAPIRVSSVFGDDDDDDNVPATATNMASASVIRVQKAAEREH 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MASKRHVGLNIRKKDEPKAAPIRVSSVFGDDDDDDNVPATATNMASASVIRVQKAAEREH 060

061 QKAEAEDPTIFDYDGNYDEIQAIKNEKKEEARKADKNRESKYAENIIKAHARRQLEQFSR 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 QKAEAEDPTIFDYDGNYDEIQAIKNEKKEEARKADKNRESKYAENIIKAHARRQLEQFSR 120

121 EERQQLREREKEGDEFDDKEVFVTGAYRKQQEEVKKHREQEAEEAAFNDMTSVQKQKLWE 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 EERQQLREREKEGDEFDDKEVFVTGAYRKQQEEVKKHREQEAEEAAFNDMTSVQKQKLWE 180

181 IGMGRTLLNDLARDPTAIKQRKKEQKNVRKREDSDEEIDPKPEKSDKKPAEKLKKSIYSD 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 IGMGRTLLNDLARDPTAIKQRKKEQKNVRKREDSDEEIDPKPEKSDKKPAEKLKKSIYSD 240

241 DSDEEKAPKPPQKNFEGDLKPGLNTVSKKKATTHAERIRQRNYTPTPPSSDDEGARAPRA 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 DSDEEKAPKPPQKNFEGDLKPGLNTVSKKKATTHAERIRQRNYTPTPPSSDDEGARAPRA 300

301 RRRTSSPSPTSRKSIESRESGSRRSPEGKSEKSEKAPKISLKDKLKPKKIDKEARLDGLK 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 RRRTSSPSPTSRKSIESRESGSRRSPEGKSEKSEKAPKISLKDKLKPKKIDKEARLDGLK 360

361 EILKQRNTEEDIEAARQRYFERKEQGIVVPPL 392
    ||||||||||||||||||||||||||||||||
361 EILKQRNTEEDIEAARQRYFERKEQGIVVPPL 392