Affine Alignment
  
Alignment between srp-1 (top C05E4.3 366aa) and srp-1 (bottom C05E4.3 366aa) score 35454

001 MSFSLINSTFTEAQFGIKLLSDLTSDQLTPCVFSPVSILLSLALVHLGAKGHTRHDIRNS 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSFSLINSTFTEAQFGIKLLSDLTSDQLTPCVFSPVSILLSLALVHLGAKGHTRHDIRNS 060

061 VVNGSTDEQFIEHFSFINKLLNSSVNDVETLIANRLFVSPEQAIRKAFTDELREHYNAET 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 VVNGSTDEQFIEHFSFINKLLNSSVNDVETLIANRLFVSPEQAIRKAFTDELREHYNAET 120

121 ATIDFKKSQEAAKIMNQFISESTKGKIPDMIKPDNLKDVDAILINAIFFQGDWRRKFGEP 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 ATIDFKKSQEAAKIMNQFISESTKGKIPDMIKPDNLKDVDAILINAIFFQGDWRRKFGEP 180

181 AESNFSISATENRLVPMLRETRDYFYNKDDEWQVIGIPFKDKSAWFAIFLPTRRFALAEN 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 AESNFSISATENRLVPMLRETRDYFYNKDDEWQVIGIPFKDKSAWFAIFLPTRRFALAEN 240

241 LKSLNAAKFHNLINNVYQEYIFLTFPKFKMDYKINLKTALAKFGLAELFTEQADLSGIGP 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 LKSLNAAKFHNLINNVYQEYIFLTFPKFKMDYKINLKTALAKFGLAELFTEQADLSGIGP 300

301 GLQLASATHQALIEVDQVGTRAAAATEAKIFFTSASSDEPLHIRVDHPFLFAIIKDNSPL 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 GLQLASATHQALIEVDQVGTRAAAATEAKIFFTSASSDEPLHIRVDHPFLFAIIKDNSPL 360

361 FLGTYT 366
    ||||||
361 FLGTYT 366