Affine Alignment
 
Alignment between cht-1 (top C04F6.3 617aa) and cht-1 (bottom C04F6.3 617aa) score 62966

001 MLLGKFLLVASFILPIAYTWTGATIRNHPADVVAARNKITSRSVARSEPTNSYIRPCYFT 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MLLGKFLLVASFILPIAYTWTGATIRNHPADVVAARNKITSRSVARSEPTNSYIRPCYFT 060

061 NWAQYRQGRAKFVPEDYTPGLCTHILFAFGWMNADYTVRAYDPADLPNDWAGEGMYRRVN 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 NWAQYRQGRAKFVPEDYTPGLCTHILFAFGWMNADYTVRAYDPADLPNDWAGEGMYRRVN 120

121 KLKVTDTQLKTLLSFGGWSFGTALFQGMAASSASRKVFIDSAITFVRTWGFDGIDIDWEY 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 KLKVTDTQLKTLLSFGGWSFGTALFQGMAASSASRKVFIDSAITFVRTWGFDGIDIDWEY 180

181 PSGATDMANYVALVKELKAACESEAGSTGKDRLLVTAAVAAGPATIDAGYDIPNLAPNFD 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 PSGATDMANYVALVKELKAACESEAGSTGKDRLLVTAAVAAGPATIDAGYDIPNLAPNFD 240

241 FILLMSYDFFGAWASLVGFNSPLYATTELPAEWNGWNVDSSARYWNQKGMPKEKIIVGMP 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 FILLMSYDFFGAWASLVGFNSPLYATTELPAEWNGWNVDSSARYWNQKGMPKEKIIVGMP 300

301 TYGRGWTLNNASAINPGTSGSPAKITQYVQEAGVGAYFEFCEMLANGATRYWDSQSQVPY 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 TYGRGWTLNNASAINPGTSGSPAKITQYVQEAGVGAYFEFCEMLANGATRYWDSQSQVPY 360

361 LVQGNQWWSYDDEESFANKMAYVKREGYGGAFVWTLDFDDFNAGCSNSNGQLYPLISVIA 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 LVQGNQWWSYDDEESFANKMAYVKREGYGGAFVWTLDFDDFNAGCSNSNGQLYPLISVIA 420

421 KELGGVIIPKKGGVTTAPTTVATTVTTGRPPMTSAVTTTTAATTTTTRAATTTTASNTNV 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 KELGGVIIPKKGGVTTAPTTVATTVTTGRPPMTSAVTTTTAATTTTTRAATTTTASNTNV 480

481 CSGKSDGFYPNSNNCGLFVLCLSSKSYSMSCPSGLQYSASLKYCTTSTASGCSVTTTRAP 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 CSGKSDGFYPNSNNCGLFVLCLSSKSYSMSCPSGLQYSASLKYCTTSTASGCSVTTTRAP 540

541 TTTTKSAPTVTTTTRAPTTTTPAFKCTKDGFFGVPSDCLKFIRCVNGISYNFECPNGLSF 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 TTTTKSAPTVTTTTRAPTTTTPAFKCTKDGFFGVPSDCLKFIRCVNGISYNFECPNGLSF 600

601 HADTMMCDRPDPSKCAK 617
    |||||||||||||||||
601 HADTMMCDRPDPSKCAK 617