Affine Alignment
 
Alignment between CD44 (top ENST00000428726.8_9 742aa) and CD44 (bottom ENST00000428726.8_9 742aa) score 75734

001 MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIDLNITCRFAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTL 060
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001 MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIDLNITCRFAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTL 060

061 PTMAQMEKALSIGFETCRYGFIEGHVVIPRIHPNSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFN 120
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061 PTMAQMEKALSIGFETCRYGFIEGHVVIPRIHPNSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFN 120

121 ASAPPEEDCTSVTDLPNAFDGPITITIVNRDGTRYVQKGEYRTNPEDIYPSNPTDDDVSS 180
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121 ASAPPEEDCTSVTDLPNAFDGPITITIVNRDGTRYVQKGEYRTNPEDIYPSNPTDDDVSS 180

181 GSSSERSSTSGGYIFYTFSTVHPIPDEDSPWITDSTDRIPATTLMSTSATATETATKRQE 240
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181 GSSSERSSTSGGYIFYTFSTVHPIPDEDSPWITDSTDRIPATTLMSTSATATETATKRQE 240

241 TWDWFSWLFLPSESKNHLHTTTQMAGTSSNTISAGWEPNEENEDERDRHLSFSGSGIDDD 300
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241 TWDWFSWLFLPSESKNHLHTTTQMAGTSSNTISAGWEPNEENEDERDRHLSFSGSGIDDD 300

301 EDFISSTISTTPRAFDHTKQNQDWTQWNPSHSNPEVLLQTTTRMTDVDRNGTTAYEGNWN 360
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361 PEAHPPLIHHEHHEEEETPHSTSTIQATPSSTTEETATQKEQWFGNRWHEGYRQTPKEDS 420
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421 HSTTGTAAASAHTSHPMQGRTTPSPEDSSWTDFFNPISHPMGRGHQAGRRMDMDSSHSIT 480
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481 LQPTANPNTGLVEDLDRTGPLSMTTQQSNSQSFSTSHEGLEEDKDHPTTSTLTSSNRNDV 540
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541 TGGRRDPNHSEGSTTLLEGYTSHYPHTKESRTFIPVTSAKTGSFGVTAVTVGDSNSNVNR 600
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601 SLSGDQDTFHPSGGSHTTHGSESDGHSHGSQEGGANTTSGPIRTPQIPEWLIILASLLAL 660
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661 ALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINSGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKESSET 720
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661 ALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINSGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKESSET 720

721 PDQFMTADETRNLQNVDMKIGV 742
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