Affine Alignment
 
Alignment between RELA (top ENST00000406246.8_10 551aa) and RELA (bottom ENST00000406246.8_10 551aa) score 55271

001 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPT 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPT 060

061 IKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQC 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 IKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFYEAELCPDRCIHSFQNLGIQC 120

121 VKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDYDLNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLS 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 VKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDYDLNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLS 180

181 HPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEARGSFS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 HPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEARGSFS 240

241 QADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRHRIEE 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 QADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRHRIEE 300

301 KRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPRPPPRRIAVPSRSSASVPKPAPQPYPFTSSLSTINY 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 KRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPRPPPRRIAVPSRSSASVPKPAPQPYPFTSSLSTINY 360

361 DEFPTMVFPSGQISQASALAPAPPQVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQA 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 DEFPTMVFPSGQISQASALAPAPPQVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVLAPGPPQA 420

421 VAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQ 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 VAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQ 480

481 GIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADM 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 GIPVAPHTTEPMLMEYPEAITRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADM 540

541 DFSALLSQISS 551
    |||||||||||
541 DFSALLSQISS 551