UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y55H10A.2Y55H10A.20chrIV 3,364,812contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
2sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
3W02D7.6W02D7.6n/achrV 8,300,526contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
4fbxa-104T06E6.13n/achrV 15,422,084C. elegans FBXA-104 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
5srab-2C04F5.5n/achrV 5,104,023C. elegans SRAB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domains IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
6ZC53.1ZC53.1n/achrX 1,912,323
7srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8B0207.8B0207.8n/achrI 5,951,441
9F55A3.5F55A3.5n/achrI 10,782,421contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
10mdt-10T09A5.6n/achrII 7,854,378C. elegans MDT-10 protein ; contains similarity to Homo sapiens Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10; ENSEMBL:ENSP00000255764
11srg-4T12A2.12n/achrIII 6,261,094C. elegans SRG-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
12T08A9.4T08A9.4n/achrX 7,313,654This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
13W03F8.3W03F8.3n/achrIV 5,187,201contains similarity to Pfam domains PF00472 (Peptidyl-tRNA hydrolase domain) , PF03462 (PCRF domain) contains similarity to Interpro domains IPR005139 (PCRF), IPR000352 (Class I peptide chain release factor)
14srh-215T20B3.3n/achrV 16,831,260C. elegans SRH-215 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001356 (Homeobox)
15srh-123F08E10.3n/achrV 17,474,702C. elegans SRH-123 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16C33H5.8C33H5.8n/achrIV 7,778,475contains similarity to Pfam domain PF00515 Tetratricopeptide repeat contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
17C10A4.6C10A4.6n/achrX 7,391,386
18rpb-6C06A1.5n/achrII 10,579,552C. elegans RPB-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01192 RNA polymerase Rpb6 contains similarity to Interpro domains IPR006110 (RNA polymerase Rpb6), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR006111 (DNA-directed RNA polymerase, 14 to 18 kDa subunit), IPR012293 (RNA polymerase subunit, RPB6/omega)
19ZK856.4ZK856.4n/achrV 10,183,835contains similarity to Interpro domain IPR011001 (Saposin-like)
20C46A5.8C46A5.8n/achrIV 7,769,193
21ZC239.16ZC239.16n/achrII 3,225,022contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
22F54C8.4F54C8.4n/achrIII 9,442,492contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
23C50E3.12C50E3.12n/achrV 7,621,252contains similarity to Homo sapiens retinitis pigmentosa 1-like 1; ENSEMBL:ENSP00000371923
24K10C2.2K10C2.2n/achrX 6,433,006contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
25F56D6.6F56D6.6n/achrIV 3,904,376
26T11F1.6T11F1.6n/achrII 2,945,352contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
27C34E10.8C34E10.8n/achrIII 5,251,598contains similarity to Leishmania major strain Friedlin Proteophosphoglycan 5.; TR:Q4FX62
28srh-45T03F7.2n/achrV 11,304,292C. elegans SRH-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
29arl-5ZK632.8n/achrIII 9,823,591arl-5 encodes a paralog of the ADP-ribosylation factor-like protein EVL-20; ARL-5 is an ortholog of mammalian ARL5.
30D1046.3D1046.3n/achrIV 8,931,564contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier)
31hex-3Y39A1C.4n/achrIII 10,851,789hex-3 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase.
32C38D4.9C38D4.9n/achrIII 4,803,842contains similarity to Pfam domains PF01170 (Putative RNA methylase family UPF0020) , PF05175 (Methyltransferase small domain) , PF08242 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR007848 (Methyltransferase small), IPR000241 (Putative RNA methylase), IPR002296 (N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site), IPR002723 (Protein of unknown function DUF43)
33adr-2T20H4.4n/achrIII 7,231,956adr-2 encodes an adenosine deaminase that acts on RNA (ADAR); ADARs are RNA-editing enzymes that deaminate adenosines to create inosines in double-stranded RNA (dsRNA); adr-2 is expressed ubiquitously in early embryos, as well as in the germline of early adults; ADR-2 is required for ADAR activity in vivo, and for normal chemotaxis.
34K07D4.2K07D4.2n/achrII 4,045,127
35F31D5.1F31D5.1n/achrII 4,220,835contains similarity to Pfam domain PF05978 Eukaryotic protein of unknown function (DUF895) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR003976 (Potassium channel, two pore-domain, TREK), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
36T10B10.8T10B10.8n/achrX 15,163,702contains similarity to Pfam domain PF01501 Glycosyl transferase family 8 contains similarity to Interpro domain IPR002495 (Glycosyl transferase, family 8)
37fbxa-181F35E12.3n/achrV 13,726,386This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
38R08H2.10R08H2.10n/achrV 15,373,870contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
39ZK512.1ZK512.1n/achrIII 9,116,087contains similarity to Interpro domain IPR007110 (Immunoglobulin-like)
40srh-206Y102A5C.15n/achrV 16,954,279C. elegans SRH-206 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41R09F10.5R09F10.5n/achrX 8,307,016
42hlh-19F57C12.3n/achrX 556,516C. elegans HLH-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
43F23H12.7F23H12.7n/achrV 12,372,277contains similarity to Interpro domain IPR001463 (Sodium:alanine symporter)
44F02H6.4F02H6.4n/achrIV 14,217,678contains similarity to Saccharomyces cerevisiae GTPase, required for general translation initiation by promoting Met-tRNAiMet binding to ribosomes and ribosomal subunit joining; homolog of bacterial IF2; SGD:YAL035W
45C07B5.6C07B5.6n/achrX 9,520,189contains similarity to Helicobacter pylori Hypothetical protein HP1327.; TR:O25885
46clec-246F16H6.2n/achrV 18,190,268C. elegans CLEC-246 protein ;
47srx-121C04E12.8n/achrV 3,371,855C. elegans SRX-121 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
48fbxb-79R07H5.7n/achrIV 11,189,235C. elegans FBXB-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
49C27F2.5C27F2.5n/achrIII 4,961,124C27F2.5 encodes the C. elegans ortholog of the conserved vacuolar protein sorting protein EAP30/SNF8/VPS22; by homology, the product of C27F2.5 is predicted to be a component of an ESCRT-II complex (Endosomal Sorting Complex Required for Transport) that functions in endosomal transport.
50F36A4.11F36A4.11n/achrIV 4,245,281