Affine Alignment
 
Alignment between SMC1 (top YFL008W 1225aa) and SMC1 (bottom YFL008W 1225aa) score 117002

0001 MGRLVGLELSNFKSYRGVTKVGFGESNFTSIIGPNGSGKSNMMDAISFVLGVRSNHLRSN 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MGRLVGLELSNFKSYRGVTKVGFGESNFTSIIGPNGSGKSNMMDAISFVLGVRSNHLRSN 0060

0061 ILKDLIYRGVLNDENSDDYDNEGAASSNPQSAYVKAFYQKGNKLVELMRIISRNGDTSYK 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 ILKDLIYRGVLNDENSDDYDNEGAASSNPQSAYVKAFYQKGNKLVELMRIISRNGDTSYK 0120

0121 IDGKTVSYKDYSIFLENENILIKAKNFLVFQGDVEQIAAQSPVELSRMFEEVSGSIQYKK 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 IDGKTVSYKDYSIFLENENILIKAKNFLVFQGDVEQIAAQSPVELSRMFEEVSGSIQYKK 0180

0181 EYEELKEKIEKLSKSATESIKNRRRIHGELKTYKEGINKNEEYRKQLDKKNELQKFQALW 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 EYEELKEKIEKLSKSATESIKNRRRIHGELKTYKEGINKNEEYRKQLDKKNELQKFQALW 0240

0241 QLYHLEQQKEELTDKLSALNSEISSLKGKINNEMKSLQRSKSSFVKESAVISKQKSKLDY 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 QLYHLEQQKEELTDKLSALNSEISSLKGKINNEMKSLQRSKSSFVKESAVISKQKSKLDY 0300

0301 IFKDKEKLVSDLRLIKVPQQAAGKRISHIEKRIESLQKDLQRQKTYVERFETQLKVVTRS 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 IFKDKEKLVSDLRLIKVPQQAAGKRISHIEKRIESLQKDLQRQKTYVERFETQLKVVTRS 0360

0361 KEAFEEEIKQSARNYDKFKLNENDLKTYNCLHEKYLTEGGSILEEKIAVLNNDKREIQEE 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 KEAFEEEIKQSARNYDKFKLNENDLKTYNCLHEKYLTEGGSILEEKIAVLNNDKREIQEE 0420

0421 LERFNKRADISKRRITEELSITGEKLDTQLNDLRVSLNEKNALHTERLHELKKLQSDIES 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 LERFNKRADISKRRITEELSITGEKLDTQLNDLRVSLNEKNALHTERLHELKKLQSDIES 0480

0481 ANNQEYDLNFKLRETLVKIDDLSANQRETMKERKLRENIAMLKRFFPGVKGLVHDLCHPK 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 ANNQEYDLNFKLRETLVKIDDLSANQRETMKERKLRENIAMLKRFFPGVKGLVHDLCHPK 0540

0541 KEKYGLAVSTILGKNFDSVIVENLTVAQECIAFLKKQRAGTASFIPLDTIETELPTLSLP 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 KEKYGLAVSTILGKNFDSVIVENLTVAQECIAFLKKQRAGTASFIPLDTIETELPTLSLP 0600

0601 DSQDYILSINAIDYEPEYEKAMQYVCGDSIICNTLNIAKDLKWKKGIRGKLVTIEGALIH 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 DSQDYILSINAIDYEPEYEKAMQYVCGDSIICNTLNIAKDLKWKKGIRGKLVTIEGALIH 0660

0661 KAGLMTGGISGDANNRWDKEEYQSLMSLKDKLLIQIDELSNGQRSNSIRAREVENSVSLL 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 KAGLMTGGISGDANNRWDKEEYQSLMSLKDKLLIQIDELSNGQRSNSIRAREVENSVSLL 0720

0721 NSDIANLRTQVTQQKRSLDENRLEIKYHNDLIEKEIQPKITELKKKLDDLENTKDNLVKE 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 NSDIANLRTQVTQQKRSLDENRLEIKYHNDLIEKEIQPKITELKKKLDDLENTKDNLVKE 0780

0781 KEALQNNIFKEFTSKIGFTIKEYENHSGELMRQQSKELQQLQKQILTVENKLQFETDRLS 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 KEALQNNIFKEFTSKIGFTIKEYENHSGELMRQQSKELQQLQKQILTVENKLQFETDRLS 0840

0841 TTQRRYEKAQKDLENAQVEMKSLEEQEYAIEMKIGSIESKLEEHKNHLDELQKKFVTKQS 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 TTQRRYEKAQKDLENAQVEMKSLEEQEYAIEMKIGSIESKLEEHKNHLDELQKKFVTKQS 0900

0901 ELNSSEDILEDMNSNLQVLKRERDGIKEDIEKFDLERVTALKNCKISNINIPISSETTID 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 ELNSSEDILEDMNSNLQVLKRERDGIKEDIEKFDLERVTALKNCKISNINIPISSETTID 0960

0961 DLPISSTDNEAITISNSIDINYKGLPKKYKENNTDSARKELEQKIHEVEEILNELQPNAR 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 DLPISSTDNEAITISNSIDINYKGLPKKYKENNTDSARKELEQKIHEVEEILNELQPNAR 1020

1021 ALERYDEAEGRFEVINNETEQLKAEEKKILNQFLKIKKKRKELFEKTFDYVSDHLDAIYR 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 ALERYDEAEGRFEVINNETEQLKAEEKKILNQFLKIKKKRKELFEKTFDYVSDHLDAIYR 1080

1081 ELTKNPNSNVELAGGNASLTIEDEDEPFNAGIKYHATPPLKRFKDMEYLSGGEKTVAALA 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 ELTKNPNSNVELAGGNASLTIEDEDEPFNAGIKYHATPPLKRFKDMEYLSGGEKTVAALA 1140

1141 LLFAINSYQPSPFFVLDEVDAALDITNVQRIAAYIRRHRNPDLQFIVISLKNTMFEKSDA 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 LLFAINSYQPSPFFVLDEVDAALDITNVQRIAAYIRRHRNPDLQFIVISLKNTMFEKSDA 1200

1201 LVGVYRQQQENSSKIITLDLSNYAE 1225
     |||||||||||||||||||||||||
1201 LVGVYRQQQENSSKIITLDLSNYAE 1225